Mon ancien sous-domaine colibri.fr reste-t-il actif ?

Oui. L'adresse colibri.fr reste valable comme back-up technique (utile si jamais le certificat HTTPS de votre domaine personnalisé pose problème). Quand vous désignez votre domaine comme adresse principale, l'adresse colibri.fr redirige automatiquement vers lui en 301 permanent — votre référencement n'est pas perdu.